Future Card Buddyfight toma lugar en una versión demasiado futurista del presente. El juego de cartas conecta universos paralelos a través de cartas especiales que actúan como portales. Estas cartas transportan monstruos a la tierra para que estos se vuelvan amigos de los humanos. A través de la amistad y el coraje se enfrentarán a duras peleas conocidas como "Buddyfights", donde la gente de todas las edades batalla en amistosas competiciones.
El personaje principal, Gaou Mikado, apenas comienza sus primeras batallas, pero conforme la historia avance, estas batallas parecerán un poco más reales...
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Secuela: Future Card Buddyfight 100